Más cercano al nombre actual es el Burguet de Roncesvalles (Comptos, 1476), conforme iba perdiendo importancia a la sombra de la creciente fama del monasterio y entidad de población circundante. Así es cómo el cambio de nombre refleja fielmente el eclipsamiento de lo que fue primitivo poblado cercano al Summus Pyreneus de la vía Astorga-Burdeos.
No sabemos cómo ni por qué, avanzado el s. XII Burguete pertenecía sin embargo a un monasterio aragonés, el de Santa Cristina de Sumo Puezto (Somport) de Aspe, que lo vendió, en mayo de 1219, al prior del hospital de Roncesvalles.En el s. XIV había ya en la localidad uno o dos albergues para los peregrinos que no querían repostar en el hospital cercano.El s. XVI se inauguza en Euskalerria con un violento recrudecimiento de persecución de prácticas no cristianas. 4 años después del intento de reconquista de Nav. de 1521, Burguete protagoniza [1525] un proceso de brujería en el que intervino el licenciado Balanza.
En el mes de junio de 1572 la localidad fue destruida casi por completo por un incendio, por lo que pidió exención de cuarteles y alcabales, cosa que al fin consiguió durante diez años. Aprovechando la dramática circunstancia, el virrey de Nav. envió al ingeniero militar Fratín, autor de la Ciudadela de Pamplona, para que aconsejara a los vecinos en la reconstrucción de la villa y orientara ésta hacia fines defensivos, ya que desde la partición del reino (1512) había quedado Burguete en la nueva frontera del estado francés con el español enzarzados en frecuentes luchas después de las tentativas de reconquista por los legítimos monarcas navarros.
El 20 de marzo de 1684, estando en estado de guerra Francia y España, penetraron por Ibañeta 7.000 infantes y 4.000 de a caballo al mando del mariscal de Bellefons. Entraron las tropas francesas ocupando Roncesvalles y Burguete sin encontrar resistencia, pero se volvieron, ya que la operación era para distraer la invasión de Cataluña. Nuevamente sé ensañó el fuego sobre la villa en 1780, destruyendo 15 casas, pero cuando verdaderamente la desgracia se encarniza es durante la guerra de la Convención en la que quedaron arrasadas o arruinadas la casi totalidad de sus 43 casas.
Ya entrado el s. XX registra la villa otro incendio, esta vez en 1910 con un balance de 12 casas destruidas.
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